페르소나 3 FES

기존 Easy, Normal 난이도 외에 상급자를 위한 Hard 난이도가 추가되었다.

감시 카메라 이벤트, 코로마루와의 산책 이벤트, 커뮤니티 MAX를 찍은 캐릭터의 후일담 등이 추가되었다.

헤카톤케일, 락샤사 등이 추가되었으며 일부 페르소나의 레벨이 조정되었다. 또한 올커뮤를 달성하면 특전 페르소나인 진 오르페우스를 생성할 수 있다.

폴로니안 몰에 추가된 골동품점 마요이당에서 무기 합체를 할 수 있다.

본편에서 메이드복이나 하이레그 아머의 특수 대사만을 보고 슬퍼했던 게이머들이 환호성을 지르게 만든 요소. 다만 전부 구현되진 않았다.

영겁 추가로 몇몇 페르소나의 카테고리가 변경되었으며, 아이기스의 공략이 가능해졌다.

사실상 엘리자베스 커뮤니티라고 봐도 무방하다. 주요 내용은 엘리자베스를 데리고 바깥 세상 구경을 하는 것.

본편은 1회차 올커뮤 달성이 어렵도록 제작진이 의도했다.[1] 이런 불만을 인지해 일부 커뮤니티의 일과를 수정하고 커뮤니티를 보조하는 요소를 넣어서 본편보다 여유롭게 1회차 올커뮤 달성을 할 수 있도록 개선했다.

커뮤니티를 보조하는 시스템. 나가나키 신사에서 인연 점괘를 뽑으면 커뮤 대상과의 친분이 깊어진다. 이로 인해 올커뮤 맥스를 찍는데 상당한 여유가 생기게 되었다. 단, 신사에서의 모든 행동이 시간 경과가 되게끔 바뀌어서 오리지널 시절에 가능했던 무한 대길 노가다와 무한 학력업 새전 투척은 불가능해졌다.

가장 큰 추가 콘텐츠. 타이틀 화면에서 페르소나 3 본편인 Episode Yourself(영문판 The Journey; 여정), 그리고 후일담인 Episode Aegis(영문판 The Answer; 해답)를 선택할 수 있다. 제목에서 알 수 있듯이 아이기스가 주인공이며, 본편의 최종 결전 이후의 이야기를 다룬다.
본편이 커뮤니티/스토리가 5할에 전투가 5할이라면, 후일담은 전투가 9할에 스토리가 1할이다. 그리고 제작진이 작정하고 본편보다 난이도를 올려서 개껌에 가까웠던 본편보다 어렵다. 아예 시작하기 전부터 '본편보다 난이도가 있습니다'라는 메시지를 띄워준다. 본편에서는 보통 적 집단이 하나의 약점을 공유하고 있어서 약점 찌르기 한방이면 정리할 수 있었던 반면에, 후일담에서는 거의 대부분이 혼성 구성이다. 그래서 마하 시리즈의 효율성이 본편보다 엄청 떨어진다. 게다가 중후반 이후에는 던전 졸개들도 대부분 빛/어둠에 내성이나 무효화를 지녀서 앨리스나 대승정의 즉사 스킬로 쓸어버리면서 진행하는 것도 힘들어진다. 중간 보스들도 난이도가 악랄해서 통상적인 정공법으론 거의 못잡을 수준의 보스도 있다.
하지만 그보다 가장 귀찮은 것은 페르소나 전서를 사용할 수 없다는 점이다. 벨벳 룸에서는 오로지 합체만을 지원한다. 그렇기 때문에 어디까지나 던전 내에서 얻은 페르소나들을 기초로 합체해가며 사용해야 한다. 커뮤니티에 의한 경험치 보너스도 없기 때문에 각종 개사기 스킬을 꽂아주거나 원하는 페르소나를 손쉽게 뽑기도 힘들다. 때문에 본편에선 그냥 덤에 가까웠던 그로우 시리즈 스킬이 후일담에서는 상당히 유용한 편이다.
대신 후일담에서는 캐릭터/페르소나의 레벨 업이 본편에 비해 훨씬 빠르다. 돈도 퍼부어주고 아이템도 잘 나와서 장비/소모품 면에서도 부담이 거의 없다. 중간 보스를 클리어하면 매지컬 미러나 소마 등의 고급 아이템도 팍팍 퍼주는 편. 사실 중후반부의 악질 중간 보스들을 상대하려면 이런 고급 아이템을 적절하게 써줘야 한다.